Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Irx3P81067 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Irx3P81067 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Irx3P81067 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Irx3P81067 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Irx3P81067 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Irx3P81067 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Irx3P81067 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms