Protein–RNA interactions for Protein: P70414

Slc8a1, Sodium/calcium exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 970 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8a1P70414 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc8a1P70414 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc8a1P70414 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc8a1P70414 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc8a1P70414 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc8a1P70414 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc8a1P70414 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc8a1P70414 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc8a1P70414 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc8a1P70414 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc8a1P70414 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc8a1P70414 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc8a1P70414 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc8a1P70414 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc8a1P70414 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc8a1P70414 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc8a1P70414 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc8a1P70414 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc8a1P70414 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc8a1P70414 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc8a1P70414 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc8a1P70414 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc8a1P70414 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc8a1P70414 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc8a1P70414 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc8a1P70414 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc8a1P70414 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc8a1P70414 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc8a1P70414 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc8a1P70414 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc8a1P70414 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc8a1P70414 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc8a1P70414 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc8a1P70414 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc8a1P70414 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc8a1P70414 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc8a1P70414 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc8a1P70414 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc8a1P70414 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc8a1P70414 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc8a1P70414 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc8a1P70414 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc8a1P70414 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc8a1P70414 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc8a1P70414 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc8a1P70414 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc8a1P70414 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc8a1P70414 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc8a1P70414 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc8a1P70414 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc8a1P70414 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc8a1P70414 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc8a1P70414 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc8a1P70414 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc8a1P70414 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc8a1P70414 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc8a1P70414 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc8a1P70414 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc8a1P70414 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc8a1P70414 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc8a1P70414 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc8a1P70414 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc8a1P70414 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc8a1P70414 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc8a1P70414 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc8a1P70414 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc8a1P70414 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc8a1P70414 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc8a1P70414 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc8a1P70414 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc8a1P70414 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc8a1P70414 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc8a1P70414 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc8a1P70414 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc8a1P70414 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc8a1P70414 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc8a1P70414 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc8a1P70414 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc8a1P70414 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc8a1P70414 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc8a1P70414 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc8a1P70414 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc8a1P70414 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc8a1P70414 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc8a1P70414 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc8a1P70414 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc8a1P70414 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc8a1P70414 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc8a1P70414 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc8a1P70414 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc8a1P70414 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc8a1P70414 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc8a1P70414 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc8a1P70414 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc8a1P70414 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc8a1P70414 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc8a1P70414 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc8a1P70414 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc8a1P70414 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc8a1P70414 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms