Protein–RNA interactions for Protein: P70281

Sycp3, Synaptonemal complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp3P70281 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms