Protein–RNA interactions for Protein: P70279

Surf6, Surfeit locus protein 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf6P70279 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Surf6P70279 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Surf6P70279 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Surf6P70279 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Surf6P70279 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Surf6P70279 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Surf6P70279 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Surf6P70279 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Surf6P70279 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Surf6P70279 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Surf6P70279 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Surf6P70279 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Surf6P70279 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Surf6P70279 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Surf6P70279 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Surf6P70279 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Surf6P70279 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Surf6P70279 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Surf6P70279 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Surf6P70279 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Surf6P70279 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Surf6P70279 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Surf6P70279 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Surf6P70279 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Surf6P70279 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Surf6P70279 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Surf6P70279 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Surf6P70279 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Surf6P70279 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Surf6P70279 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Surf6P70279 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Surf6P70279 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Surf6P70279 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Surf6P70279 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Surf6P70279 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Surf6P70279 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Surf6P70279 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Surf6P70279 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Surf6P70279 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Surf6P70279 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Surf6P70279 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms