Protein–RNA interactions for Protein: P70268

Pkn1, Serine/threonine-protein kinase N1, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn1P70268 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkn1P70268 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkn1P70268 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkn1P70268 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkn1P70268 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkn1P70268 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkn1P70268 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkn1P70268 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkn1P70268 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkn1P70268 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkn1P70268 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkn1P70268 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkn1P70268 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkn1P70268 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkn1P70268 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkn1P70268 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkn1P70268 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkn1P70268 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkn1P70268 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkn1P70268 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkn1P70268 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkn1P70268 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkn1P70268 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkn1P70268 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkn1P70268 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkn1P70268 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkn1P70268 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkn1P70268 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkn1P70268 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkn1P70268 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkn1P70268 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkn1P70268 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkn1P70268 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkn1P70268 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkn1P70268 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkn1P70268 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkn1P70268 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkn1P70268 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkn1P70268 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkn1P70268 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkn1P70268 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkn1P70268 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkn1P70268 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkn1P70268 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkn1P70268 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkn1P70268 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkn1P70268 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkn1P70268 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkn1P70268 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkn1P70268 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkn1P70268 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkn1P70268 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkn1P70268 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkn1P70268 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkn1P70268 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkn1P70268 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkn1P70268 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkn1P70268 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkn1P70268 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkn1P70268 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkn1P70268 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkn1P70268 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkn1P70268 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkn1P70268 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkn1P70268 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkn1P70268 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkn1P70268 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkn1P70268 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkn1P70268 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkn1P70268 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkn1P70268 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkn1P70268 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkn1P70268 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkn1P70268 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkn1P70268 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkn1P70268 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pkn1P70268 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pkn1P70268 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pkn1P70268 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pkn1P70268 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pkn1P70268 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms