Protein–RNA interactions for Protein: P70193

Lrig1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig1P70193 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrig1P70193 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrig1P70193 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrig1P70193 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrig1P70193 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrig1P70193 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrig1P70193 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrig1P70193 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrig1P70193 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrig1P70193 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrig1P70193 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrig1P70193 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrig1P70193 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrig1P70193 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrig1P70193 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrig1P70193 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrig1P70193 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrig1P70193 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrig1P70193 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrig1P70193 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrig1P70193 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrig1P70193 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrig1P70193 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrig1P70193 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrig1P70193 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrig1P70193 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrig1P70193 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrig1P70193 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrig1P70193 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrig1P70193 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrig1P70193 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrig1P70193 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrig1P70193 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrig1P70193 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrig1P70193 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrig1P70193 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrig1P70193 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrig1P70193 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrig1P70193 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrig1P70193 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrig1P70193 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrig1P70193 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrig1P70193 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrig1P70193 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrig1P70193 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrig1P70193 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrig1P70193 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrig1P70193 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrig1P70193 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrig1P70193 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrig1P70193 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrig1P70193 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrig1P70193 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrig1P70193 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrig1P70193 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrig1P70193 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrig1P70193 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrig1P70193 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrig1P70193 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrig1P70193 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrig1P70193 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrig1P70193 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrig1P70193 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrig1P70193 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrig1P70193 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrig1P70193 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrig1P70193 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrig1P70193 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrig1P70193 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrig1P70193 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrig1P70193 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrig1P70193 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrig1P70193 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrig1P70193 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrig1P70193 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrig1P70193 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrig1P70193 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrig1P70193 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrig1P70193 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrig1P70193 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrig1P70193 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrig1P70193 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrig1P70193 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrig1P70193 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrig1P70193 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrig1P70193 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrig1P70193 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrig1P70193 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrig1P70193 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrig1P70193 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrig1P70193 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrig1P70193 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrig1P70193 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrig1P70193 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrig1P70193 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrig1P70193 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrig1P70193 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrig1P70193 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrig1P70193 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrig1P70193 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms