Protein–RNA interactions for Protein: P68404

Prkcb, Protein kinase C beta type, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcbP68404 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrkcbP68404 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrkcbP68404 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrkcbP68404 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrkcbP68404 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrkcbP68404 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrkcbP68404 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrkcbP68404 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcbP68404 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcbP68404 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcbP68404 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcbP68404 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcbP68404 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcbP68404 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcbP68404 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcbP68404 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcbP68404 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcbP68404 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcbP68404 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcbP68404 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcbP68404 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcbP68404 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcbP68404 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcbP68404 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcbP68404 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcbP68404 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcbP68404 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcbP68404 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcbP68404 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcbP68404 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcbP68404 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcbP68404 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcbP68404 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcbP68404 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcbP68404 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcbP68404 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcbP68404 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcbP68404 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcbP68404 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcbP68404 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcbP68404 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcbP68404 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcbP68404 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcbP68404 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcbP68404 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcbP68404 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcbP68404 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcbP68404 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcbP68404 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcbP68404 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcbP68404 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcbP68404 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcbP68404 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcbP68404 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcbP68404 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcbP68404 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcbP68404 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcbP68404 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcbP68404 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcbP68404 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcbP68404 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcbP68404 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcbP68404 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcbP68404 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcbP68404 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcbP68404 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcbP68404 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcbP68404 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcbP68404 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcbP68404 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcbP68404 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcbP68404 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcbP68404 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrkcbP68404 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrkcbP68404 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrkcbP68404 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrkcbP68404 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrkcbP68404 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrkcbP68404 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrkcbP68404 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrkcbP68404 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrkcbP68404 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrkcbP68404 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrkcbP68404 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrkcbP68404 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrkcbP68404 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrkcbP68404 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrkcbP68404 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrkcbP68404 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PrkcbP68404 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrkcbP68404 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PrkcbP68404 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrkcbP68404 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrkcbP68404 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PrkcbP68404 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrkcbP68404 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrkcbP68404 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrkcbP68404 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrkcbP68404 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrkcbP68404 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms