Protein–RNA interactions for Protein: P63080

Gabrb3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrb3P63080 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms