Protein–RNA interactions for Protein: P62717

Rpl18a, 60S ribosomal protein L18a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl18aP62717 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl18aP62717 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl18aP62717 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl18aP62717 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl18aP62717 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl18aP62717 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl18aP62717 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl18aP62717 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl18aP62717 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl18aP62717 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl18aP62717 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl18aP62717 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl18aP62717 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl18aP62717 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl18aP62717 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl18aP62717 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl18aP62717 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl18aP62717 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl18aP62717 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl18aP62717 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl18aP62717 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl18aP62717 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl18aP62717 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl18aP62717 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl18aP62717 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl18aP62717 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl18aP62717 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl18aP62717 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl18aP62717 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl18aP62717 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl18aP62717 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl18aP62717 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl18aP62717 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl18aP62717 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl18aP62717 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl18aP62717 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl18aP62717 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl18aP62717 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl18aP62717 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl18aP62717 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl18aP62717 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl18aP62717 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl18aP62717 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl18aP62717 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl18aP62717 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl18aP62717 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl18aP62717 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl18aP62717 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl18aP62717 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl18aP62717 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl18aP62717 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl18aP62717 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl18aP62717 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl18aP62717 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl18aP62717 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl18aP62717 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl18aP62717 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl18aP62717 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl18aP62717 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl18aP62717 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl18aP62717 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl18aP62717 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl18aP62717 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl18aP62717 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl18aP62717 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl18aP62717 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl18aP62717 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl18aP62717 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl18aP62717 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl18aP62717 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl18aP62717 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl18aP62717 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl18aP62717 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl18aP62717 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl18aP62717 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl18aP62717 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl18aP62717 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl18aP62717 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl18aP62717 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl18aP62717 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl18aP62717 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl18aP62717 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl18aP62717 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl18aP62717 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl18aP62717 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl18aP62717 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl18aP62717 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl18aP62717 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl18aP62717 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl18aP62717 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl18aP62717 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl18aP62717 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl18aP62717 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl18aP62717 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl18aP62717 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl18aP62717 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl18aP62717 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl18aP62717 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl18aP62717 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl18aP62717 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms