Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Rps29P62274 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Rps29P62274 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
Rps29P62274 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Rps29P62274 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Rps29P62274 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Rps29P62274 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Rps29P62274 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms