Protein–RNA interactions for Protein: P60334

Cdo1, Cysteine dioxygenase type 1, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdo1P60334 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdo1P60334 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdo1P60334 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdo1P60334 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdo1P60334 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdo1P60334 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdo1P60334 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdo1P60334 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdo1P60334 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdo1P60334 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdo1P60334 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdo1P60334 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdo1P60334 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdo1P60334 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdo1P60334 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdo1P60334 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdo1P60334 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdo1P60334 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdo1P60334 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdo1P60334 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdo1P60334 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdo1P60334 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdo1P60334 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdo1P60334 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdo1P60334 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdo1P60334 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms