Protein–RNA interactions for Protein: P60229

Eif3e, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3eP60229 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms