Protein–RNA interactions for Protein: P59708

Sf3b6, Splicing factor 3B subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b6P59708 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b6P59708 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b6P59708 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b6P59708 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b6P59708 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b6P59708 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b6P59708 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b6P59708 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b6P59708 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b6P59708 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b6P59708 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b6P59708 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b6P59708 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b6P59708 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b6P59708 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b6P59708 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b6P59708 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b6P59708 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b6P59708 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b6P59708 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b6P59708 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b6P59708 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b6P59708 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b6P59708 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b6P59708 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b6P59708 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b6P59708 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b6P59708 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b6P59708 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b6P59708 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b6P59708 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b6P59708 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b6P59708 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b6P59708 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b6P59708 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b6P59708 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b6P59708 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b6P59708 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b6P59708 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b6P59708 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b6P59708 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b6P59708 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b6P59708 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b6P59708 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b6P59708 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b6P59708 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b6P59708 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b6P59708 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b6P59708 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b6P59708 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b6P59708 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b6P59708 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b6P59708 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b6P59708 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b6P59708 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b6P59708 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b6P59708 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b6P59708 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b6P59708 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b6P59708 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b6P59708 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b6P59708 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b6P59708 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b6P59708 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf3b6P59708 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf3b6P59708 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf3b6P59708 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf3b6P59708 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf3b6P59708 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf3b6P59708 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf3b6P59708 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf3b6P59708 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf3b6P59708 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf3b6P59708 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf3b6P59708 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf3b6P59708 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf3b6P59708 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf3b6P59708 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf3b6P59708 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf3b6P59708 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf3b6P59708 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf3b6P59708 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf3b6P59708 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf3b6P59708 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf3b6P59708 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf3b6P59708 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf3b6P59708 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf3b6P59708 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf3b6P59708 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf3b6P59708 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf3b6P59708 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf3b6P59708 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf3b6P59708 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf3b6P59708 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf3b6P59708 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf3b6P59708 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf3b6P59708 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf3b6P59708 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf3b6P59708 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf3b6P59708 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms