Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Csrnp3P59055 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Csrnp3P59055 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Csrnp3P59055 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Csrnp3P59055 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Csrnp3P59055 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Csrnp3P59055 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Csrnp3P59055 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Csrnp3P59055 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Csrnp3P59055 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Csrnp3P59055 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Csrnp3P59055 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Csrnp3P59055 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Csrnp3P59055 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Csrnp3P59055 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Csrnp3P59055 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Csrnp3P59055 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Csrnp3P59055 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Csrnp3P59055 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Csrnp3P59055 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Csrnp3P59055 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Csrnp3P59055 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Csrnp3P59055 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Csrnp3P59055 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Csrnp3P59055 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Csrnp3P59055 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Csrnp3P59055 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Csrnp3P59055 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Csrnp3P59055 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Csrnp3P59055 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Csrnp3P59055 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Csrnp3P59055 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Csrnp3P59055 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Csrnp3P59055 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Csrnp3P59055 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Csrnp3P59055 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Csrnp3P59055 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Csrnp3P59055 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Csrnp3P59055 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Csrnp3P59055 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Csrnp3P59055 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Csrnp3P59055 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Csrnp3P59055 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Csrnp3P59055 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Csrnp3P59055 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Csrnp3P59055 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Csrnp3P59055 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Csrnp3P59055 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Csrnp3P59055 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Csrnp3P59055 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Csrnp3P59055 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Csrnp3P59055 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Csrnp3P59055 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Csrnp3P59055 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Csrnp3P59055 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Csrnp3P59055 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Csrnp3P59055 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Csrnp3P59055 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Csrnp3P59055 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Csrnp3P59055 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Csrnp3P59055 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Csrnp3P59055 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Csrnp3P59055 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Csrnp3P59055 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Csrnp3P59055 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Csrnp3P59055 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Csrnp3P59055 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Csrnp3P59055 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Csrnp3P59055 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Csrnp3P59055 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Csrnp3P59055 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Csrnp3P59055 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Csrnp3P59055 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Csrnp3P59055 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Csrnp3P59055 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Csrnp3P59055 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Csrnp3P59055 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Csrnp3P59055 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Csrnp3P59055 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Csrnp3P59055 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Csrnp3P59055 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Csrnp3P59055 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Csrnp3P59055 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Csrnp3P59055 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Csrnp3P59055 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Csrnp3P59055 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Csrnp3P59055 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Csrnp3P59055 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Csrnp3P59055 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Csrnp3P59055 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Csrnp3P59055 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Csrnp3P59055 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Csrnp3P59055 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Csrnp3P59055 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Csrnp3P59055 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Csrnp3P59055 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Csrnp3P59055 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Csrnp3P59055 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Csrnp3P59055 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Csrnp3P59055 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms