Protein–RNA interactions for Protein: P59054

Csrnp1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp1P59054 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms