Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms