Protein–RNA interactions for Protein: P56716

Rp1, Oxygen-regulated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,095 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rp1P56716 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rp1P56716 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rp1P56716 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rp1P56716 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rp1P56716 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rp1P56716 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rp1P56716 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rp1P56716 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rp1P56716 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rp1P56716 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rp1P56716 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms