Protein–RNA interactions for Protein: P55271

Cdkn2b, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor B, mousemouse

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Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2bP55271 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdkn2bP55271 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdkn2bP55271 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdkn2bP55271 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdkn2bP55271 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdkn2bP55271 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdkn2bP55271 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdkn2bP55271 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdkn2bP55271 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdkn2bP55271 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdkn2bP55271 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdkn2bP55271 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdkn2bP55271 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdkn2bP55271 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdkn2bP55271 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdkn2bP55271 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdkn2bP55271 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdkn2bP55271 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdkn2bP55271 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdkn2bP55271 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdkn2bP55271 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdkn2bP55271 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdkn2bP55271 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdkn2bP55271 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdkn2bP55271 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdkn2bP55271 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdkn2bP55271 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdkn2bP55271 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdkn2bP55271 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdkn2bP55271 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdkn2bP55271 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdkn2bP55271 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdkn2bP55271 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdkn2bP55271 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdkn2bP55271 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdkn2bP55271 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdkn2bP55271 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdkn2bP55271 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdkn2bP55271 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdkn2bP55271 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdkn2bP55271 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdkn2bP55271 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdkn2bP55271 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdkn2bP55271 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdkn2bP55271 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdkn2bP55271 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdkn2bP55271 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdkn2bP55271 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdkn2bP55271 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdkn2bP55271 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdkn2bP55271 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdkn2bP55271 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdkn2bP55271 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdkn2bP55271 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdkn2bP55271 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdkn2bP55271 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdkn2bP55271 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdkn2bP55271 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdkn2bP55271 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdkn2bP55271 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdkn2bP55271 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdkn2bP55271 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdkn2bP55271 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdkn2bP55271 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdkn2bP55271 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdkn2bP55271 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdkn2bP55271 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdkn2bP55271 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdkn2bP55271 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdkn2bP55271 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdkn2bP55271 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdkn2bP55271 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdkn2bP55271 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdkn2bP55271 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdkn2bP55271 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdkn2bP55271 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdkn2bP55271 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdkn2bP55271 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdkn2bP55271 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdkn2bP55271 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdkn2bP55271 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdkn2bP55271 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdkn2bP55271 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdkn2bP55271 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdkn2bP55271 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdkn2bP55271 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdkn2bP55271 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdkn2bP55271 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdkn2bP55271 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdkn2bP55271 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdkn2bP55271 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdkn2bP55271 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdkn2bP55271 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdkn2bP55271 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdkn2bP55271 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdkn2bP55271 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdkn2bP55271 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdkn2bP55271 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdkn2bP55271 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdkn2bP55271 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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