Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

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Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NcanP55066 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NcanP55066 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NcanP55066 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NcanP55066 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NcanP55066 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NcanP55066 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NcanP55066 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NcanP55066 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NcanP55066 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NcanP55066 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NcanP55066 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NcanP55066 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NcanP55066 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NcanP55066 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NcanP55066 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NcanP55066 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NcanP55066 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NcanP55066 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NcanP55066 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NcanP55066 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NcanP55066 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NcanP55066 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NcanP55066 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NcanP55066 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NcanP55066 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NcanP55066 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NcanP55066 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NcanP55066 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NcanP55066 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NcanP55066 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NcanP55066 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NcanP55066 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NcanP55066 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NcanP55066 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NcanP55066 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NcanP55066 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NcanP55066 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NcanP55066 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NcanP55066 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NcanP55066 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NcanP55066 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NcanP55066 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NcanP55066 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NcanP55066 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NcanP55066 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NcanP55066 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NcanP55066 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NcanP55066 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NcanP55066 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NcanP55066 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NcanP55066 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NcanP55066 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NcanP55066 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NcanP55066 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NcanP55066 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NcanP55066 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NcanP55066 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NcanP55066 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NcanP55066 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NcanP55066 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NcanP55066 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NcanP55066 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NcanP55066 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NcanP55066 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NcanP55066 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NcanP55066 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NcanP55066 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NcanP55066 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NcanP55066 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NcanP55066 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NcanP55066 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NcanP55066 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NcanP55066 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NcanP55066 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NcanP55066 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NcanP55066 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NcanP55066 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NcanP55066 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NcanP55066 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NcanP55066 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NcanP55066 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NcanP55066 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NcanP55066 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NcanP55066 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NcanP55066 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NcanP55066 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NcanP55066 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NcanP55066 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NcanP55066 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NcanP55066 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NcanP55066 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NcanP55066 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NcanP55066 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NcanP55066 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NcanP55066 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NcanP55066 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NcanP55066 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NcanP55066 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NcanP55066 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms