Protein–RNA interactions for Protein: P54846

Nrl, Neural retina-specific leucine zipper protein, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrlP54846 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NrlP54846 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NrlP54846 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NrlP54846 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NrlP54846 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NrlP54846 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NrlP54846 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NrlP54846 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NrlP54846 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NrlP54846 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NrlP54846 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NrlP54846 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NrlP54846 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NrlP54846 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NrlP54846 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NrlP54846 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NrlP54846 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NrlP54846 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NrlP54846 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NrlP54846 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NrlP54846 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NrlP54846 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NrlP54846 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NrlP54846 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NrlP54846 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NrlP54846 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NrlP54846 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NrlP54846 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NrlP54846 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NrlP54846 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NrlP54846 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NrlP54846 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NrlP54846 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NrlP54846 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NrlP54846 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NrlP54846 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NrlP54846 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NrlP54846 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NrlP54846 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NrlP54846 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NrlP54846 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NrlP54846 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NrlP54846 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NrlP54846 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NrlP54846 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NrlP54846 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NrlP54846 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NrlP54846 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NrlP54846 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NrlP54846 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NrlP54846 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NrlP54846 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NrlP54846 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NrlP54846 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NrlP54846 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NrlP54846 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NrlP54846 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NrlP54846 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NrlP54846 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NrlP54846 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NrlP54846 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NrlP54846 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NrlP54846 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NrlP54846 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NrlP54846 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NrlP54846 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NrlP54846 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NrlP54846 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NrlP54846 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NrlP54846 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NrlP54846 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NrlP54846 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NrlP54846 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NrlP54846 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NrlP54846 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NrlP54846 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NrlP54846 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NrlP54846 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NrlP54846 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NrlP54846 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NrlP54846 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NrlP54846 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NrlP54846 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NrlP54846 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NrlP54846 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NrlP54846 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NrlP54846 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NrlP54846 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NrlP54846 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NrlP54846 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NrlP54846 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NrlP54846 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NrlP54846 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NrlP54846 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NrlP54846 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NrlP54846 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NrlP54846 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NrlP54846 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NrlP54846 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NrlP54846 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms