Protein–RNA interactions for Protein: P54754

Ephb3, Ephrin type-B receptor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb3P54754 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms