Protein–RNA interactions for Protein: P52950

Dbx1, Homeobox protein DBX1, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dbx1P52950 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dbx1P52950 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dbx1P52950 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dbx1P52950 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dbx1P52950 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dbx1P52950 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dbx1P52950 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dbx1P52950 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dbx1P52950 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dbx1P52950 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dbx1P52950 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dbx1P52950 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dbx1P52950 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dbx1P52950 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dbx1P52950 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dbx1P52950 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dbx1P52950 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dbx1P52950 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dbx1P52950 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dbx1P52950 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dbx1P52950 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dbx1P52950 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dbx1P52950 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dbx1P52950 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dbx1P52950 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dbx1P52950 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dbx1P52950 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dbx1P52950 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dbx1P52950 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dbx1P52950 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dbx1P52950 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Dbx1P52950 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Dbx1P52950 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dbx1P52950 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Dbx1P52950 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Dbx1P52950 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dbx1P52950 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dbx1P52950 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dbx1P52950 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dbx1P52950 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dbx1P52950 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dbx1P52950 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dbx1P52950 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dbx1P52950 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dbx1P52950 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dbx1P52950 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dbx1P52950 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dbx1P52950 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dbx1P52950 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dbx1P52950 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dbx1P52950 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dbx1P52950 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dbx1P52950 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Dbx1P52950 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Dbx1P52950 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dbx1P52950 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Dbx1P52950 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dbx1P52950 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dbx1P52950 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Dbx1P52950 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dbx1P52950 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Dbx1P52950 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dbx1P52950 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dbx1P52950 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dbx1P52950 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dbx1P52950 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dbx1P52950 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dbx1P52950 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dbx1P52950 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dbx1P52950 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dbx1P52950 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dbx1P52950 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dbx1P52950 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dbx1P52950 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dbx1P52950 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dbx1P52950 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dbx1P52950 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dbx1P52950 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dbx1P52950 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dbx1P52950 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dbx1P52950 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dbx1P52950 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dbx1P52950 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Dbx1P52950 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dbx1P52950 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dbx1P52950 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dbx1P52950 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dbx1P52950 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dbx1P52950 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dbx1P52950 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dbx1P52950 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dbx1P52950 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dbx1P52950 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dbx1P52950 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Dbx1P52950 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dbx1P52950 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Dbx1P52950 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dbx1P52950 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dbx1P52950 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dbx1P52950 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms