Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Upp1P52624 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Upp1P52624 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Upp1P52624 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Upp1P52624 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Upp1P52624 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Upp1P52624 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Upp1P52624 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Upp1P52624 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Upp1P52624 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Upp1P52624 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms