Protein–RNA interactions for Protein: P51944

Ccnf, Cyclin-F, mousemouse

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnfP51944 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CcnfP51944 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CcnfP51944 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CcnfP51944 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CcnfP51944 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CcnfP51944 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CcnfP51944 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CcnfP51944 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CcnfP51944 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CcnfP51944 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CcnfP51944 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CcnfP51944 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CcnfP51944 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CcnfP51944 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CcnfP51944 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CcnfP51944 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CcnfP51944 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CcnfP51944 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CcnfP51944 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CcnfP51944 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CcnfP51944 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CcnfP51944 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CcnfP51944 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CcnfP51944 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CcnfP51944 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CcnfP51944 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CcnfP51944 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CcnfP51944 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CcnfP51944 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CcnfP51944 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CcnfP51944 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CcnfP51944 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms