Protein–RNA interactions for Protein: P50752

Tnnt2, Troponin T, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt2P50752 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnnt2P50752 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnnt2P50752 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnnt2P50752 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnnt2P50752 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnnt2P50752 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnnt2P50752 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnnt2P50752 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnnt2P50752 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnnt2P50752 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnnt2P50752 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnnt2P50752 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnnt2P50752 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnnt2P50752 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnnt2P50752 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnnt2P50752 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnnt2P50752 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnnt2P50752 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnnt2P50752 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnnt2P50752 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnnt2P50752 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnnt2P50752 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnnt2P50752 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnnt2P50752 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnnt2P50752 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnnt2P50752 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnnt2P50752 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnnt2P50752 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnnt2P50752 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnnt2P50752 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnnt2P50752 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnnt2P50752 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnnt2P50752 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnnt2P50752 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnnt2P50752 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnnt2P50752 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnnt2P50752 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnnt2P50752 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnnt2P50752 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnnt2P50752 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnnt2P50752 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tnnt2P50752 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Tnnt2P50752 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tnnt2P50752 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tnnt2P50752 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tnnt2P50752 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tnnt2P50752 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tnnt2P50752 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Tnnt2P50752 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnnt2P50752 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnnt2P50752 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnnt2P50752 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnnt2P50752 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnnt2P50752 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnnt2P50752 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnnt2P50752 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnnt2P50752 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnnt2P50752 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnnt2P50752 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnnt2P50752 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnnt2P50752 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnnt2P50752 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnnt2P50752 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnnt2P50752 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnnt2P50752 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnnt2P50752 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnnt2P50752 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnnt2P50752 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnnt2P50752 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnnt2P50752 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnnt2P50752 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnnt2P50752 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnnt2P50752 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnnt2P50752 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnnt2P50752 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnnt2P50752 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnnt2P50752 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnnt2P50752 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnnt2P50752 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnnt2P50752 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnnt2P50752 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnnt2P50752 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnnt2P50752 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnnt2P50752 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnnt2P50752 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnnt2P50752 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnnt2P50752 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnnt2P50752 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnnt2P50752 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnnt2P50752 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnnt2P50752 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnnt2P50752 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnnt2P50752 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnnt2P50752 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnnt2P50752 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnnt2P50752 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnnt2P50752 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnnt2P50752 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnnt2P50752 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnnt2P50752 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms