Protein–RNA interactions for Protein: P50706

Defa8, Alpha-defensin 8 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa8P50706 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defa8P50706 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defa8P50706 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defa8P50706 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defa8P50706 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defa8P50706 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defa8P50706 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defa8P50706 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Defa8P50706 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Defa8P50706 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Defa8P50706 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Defa8P50706 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Defa8P50706 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Defa8P50706 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Defa8P50706 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Defa8P50706 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Defa8P50706 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Defa8P50706 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Defa8P50706 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Defa8P50706 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Defa8P50706 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Defa8P50706 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Defa8P50706 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Defa8P50706 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Defa8P50706 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Defa8P50706 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Defa8P50706 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Defa8P50706 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Defa8P50706 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Defa8P50706 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Defa8P50706 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Defa8P50706 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Defa8P50706 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Defa8P50706 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Defa8P50706 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Defa8P50706 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Defa8P50706 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Defa8P50706 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Defa8P50706 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Defa8P50706 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Defa8P50706 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Defa8P50706 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Defa8P50706 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Defa8P50706 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Defa8P50706 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Defa8P50706 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Defa8P50706 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Defa8P50706 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Defa8P50706 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Defa8P50706 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Defa8P50706 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Defa8P50706 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Defa8P50706 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Defa8P50706 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Defa8P50706 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Defa8P50706 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Defa8P50706 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Defa8P50706 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Defa8P50706 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Defa8P50706 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Defa8P50706 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Defa8P50706 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Defa8P50706 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Defa8P50706 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Defa8P50706 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Defa8P50706 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Defa8P50706 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Defa8P50706 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Defa8P50706 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Defa8P50706 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Defa8P50706 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Defa8P50706 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Defa8P50706 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Defa8P50706 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms