Protein–RNA interactions for Protein: P50446

Krt6a, Keratin, type II cytoskeletal 6A, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt6aP50446 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt6aP50446 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt6aP50446 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt6aP50446 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt6aP50446 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt6aP50446 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt6aP50446 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt6aP50446 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt6aP50446 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt6aP50446 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt6aP50446 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt6aP50446 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt6aP50446 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt6aP50446 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt6aP50446 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt6aP50446 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt6aP50446 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt6aP50446 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt6aP50446 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt6aP50446 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt6aP50446 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt6aP50446 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt6aP50446 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt6aP50446 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt6aP50446 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt6aP50446 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt6aP50446 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt6aP50446 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt6aP50446 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt6aP50446 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt6aP50446 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt6aP50446 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt6aP50446 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt6aP50446 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt6aP50446 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt6aP50446 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt6aP50446 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt6aP50446 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt6aP50446 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt6aP50446 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt6aP50446 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt6aP50446 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt6aP50446 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt6aP50446 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt6aP50446 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt6aP50446 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt6aP50446 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt6aP50446 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt6aP50446 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt6aP50446 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt6aP50446 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt6aP50446 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt6aP50446 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt6aP50446 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt6aP50446 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt6aP50446 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt6aP50446 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt6aP50446 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt6aP50446 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Krt6aP50446 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt6aP50446 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt6aP50446 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt6aP50446 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt6aP50446 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt6aP50446 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt6aP50446 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt6aP50446 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt6aP50446 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt6aP50446 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt6aP50446 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt6aP50446 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt6aP50446 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt6aP50446 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt6aP50446 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt6aP50446 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt6aP50446 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt6aP50446 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt6aP50446 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt6aP50446 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt6aP50446 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt6aP50446 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt6aP50446 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt6aP50446 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt6aP50446 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt6aP50446 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt6aP50446 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt6aP50446 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt6aP50446 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt6aP50446 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt6aP50446 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt6aP50446 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt6aP50446 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt6aP50446 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt6aP50446 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt6aP50446 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt6aP50446 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt6aP50446 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt6aP50446 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt6aP50446 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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