Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms