Protein–RNA interactions for Protein: P49222

Epb42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb42P49222 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Epb42P49222 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Epb42P49222 Gm37083-201ENSMUST00000195784 711 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Epb42P49222 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Epb42P49222 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Epb42P49222 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Epb42P49222 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Epb42P49222 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Epb42P49222 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Epb42P49222 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Epb42P49222 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Epb42P49222 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Epb42P49222 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Epb42P49222 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Epb42P49222 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Epb42P49222 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Epb42P49222 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Epb42P49222 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Epb42P49222 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Epb42P49222 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Epb42P49222 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Epb42P49222 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Epb42P49222 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Epb42P49222 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Epb42P49222 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Epb42P49222 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Epb42P49222 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Epb42P49222 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Epb42P49222 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Epb42P49222 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Epb42P49222 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Epb42P49222 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Epb42P49222 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Epb42P49222 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Epb42P49222 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Epb42P49222 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Epb42P49222 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Epb42P49222 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Epb42P49222 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Epb42P49222 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Epb42P49222 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Epb42P49222 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Epb42P49222 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Epb42P49222 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Epb42P49222 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Epb42P49222 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Epb42P49222 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Epb42P49222 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Epb42P49222 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Epb42P49222 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Epb42P49222 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Epb42P49222 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Epb42P49222 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Epb42P49222 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms