Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnni3P48787 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnni3P48787 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnni3P48787 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnni3P48787 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnni3P48787 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnni3P48787 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnni3P48787 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnni3P48787 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnni3P48787 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnni3P48787 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnni3P48787 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnni3P48787 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnni3P48787 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnni3P48787 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnni3P48787 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnni3P48787 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnni3P48787 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnni3P48787 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnni3P48787 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnni3P48787 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnni3P48787 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnni3P48787 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnni3P48787 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnni3P48787 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnni3P48787 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnni3P48787 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnni3P48787 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnni3P48787 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnni3P48787 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnni3P48787 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnni3P48787 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnni3P48787 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnni3P48787 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnni3P48787 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnni3P48787 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnni3P48787 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnni3P48787 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnni3P48787 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnni3P48787 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnni3P48787 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnni3P48787 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnni3P48787 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnni3P48787 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnni3P48787 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnni3P48787 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnni3P48787 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnni3P48787 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnni3P48787 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnni3P48787 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnni3P48787 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnni3P48787 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnni3P48787 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnni3P48787 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnni3P48787 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnni3P48787 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnni3P48787 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnni3P48787 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms