Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Abcd1P48410 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Abcd1P48410 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Abcd1P48410 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Abcd1P48410 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Abcd1P48410 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Abcd1P48410 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Abcd1P48410 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Abcd1P48410 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms