Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nedd4P46935 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nedd4P46935 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nedd4P46935 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nedd4P46935 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nedd4P46935 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nedd4P46935 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nedd4P46935 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nedd4P46935 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Nedd4P46935 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Nedd4P46935 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nedd4P46935 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nedd4P46935 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nedd4P46935 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nedd4P46935 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nedd4P46935 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nedd4P46935 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nedd4P46935 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nedd4P46935 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nedd4P46935 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nedd4P46935 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nedd4P46935 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nedd4P46935 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nedd4P46935 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nedd4P46935 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nedd4P46935 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nedd4P46935 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nedd4P46935 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nedd4P46935 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Nedd4P46935 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nedd4P46935 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Nedd4P46935 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nedd4P46935 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nedd4P46935 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Nedd4P46935 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nedd4P46935 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nedd4P46935 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nedd4P46935 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nedd4P46935 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nedd4P46935 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nedd4P46935 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nedd4P46935 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nedd4P46935 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nedd4P46935 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nedd4P46935 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Nedd4P46935 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nedd4P46935 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nedd4P46935 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nedd4P46935 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nedd4P46935 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nedd4P46935 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nedd4P46935 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nedd4P46935 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nedd4P46935 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Nedd4P46935 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nedd4P46935 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nedd4P46935 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nedd4P46935 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nedd4P46935 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nedd4P46935 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nedd4P46935 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Nedd4P46935 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nedd4P46935 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nedd4P46935 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nedd4P46935 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Nedd4P46935 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Nedd4P46935 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nedd4P46935 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Nedd4P46935 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nedd4P46935 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nedd4P46935 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Nedd4P46935 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nedd4P46935 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nedd4P46935 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nedd4P46935 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nedd4P46935 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nedd4P46935 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nedd4P46935 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nedd4P46935 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nedd4P46935 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nedd4P46935 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nedd4P46935 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nedd4P46935 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nedd4P46935 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nedd4P46935 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Nedd4P46935 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Nedd4P46935 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nedd4P46935 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nedd4P46935 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nedd4P46935 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nedd4P46935 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nedd4P46935 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms