Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ItgavP43406 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.64■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ItgavP43406 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ItgavP43406 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ItgavP43406 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ItgavP43406 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ItgavP43406 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ItgavP43406 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms