Protein–RNA interactions for Protein: P43345

Tlx1, T-cell leukemia homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx1P43345 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms