Protein–RNA interactions for Protein: P39749

Fen1, Flap endonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fen1P39749 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fen1P39749 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fen1P39749 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fen1P39749 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fen1P39749 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fen1P39749 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fen1P39749 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fen1P39749 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fen1P39749 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fen1P39749 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fen1P39749 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fen1P39749 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Fen1P39749 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fen1P39749 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fen1P39749 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fen1P39749 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fen1P39749 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fen1P39749 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fen1P39749 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fen1P39749 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Fen1P39749 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Fen1P39749 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fen1P39749 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fen1P39749 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fen1P39749 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fen1P39749 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fen1P39749 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fen1P39749 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fen1P39749 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fen1P39749 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fen1P39749 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fen1P39749 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fen1P39749 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fen1P39749 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fen1P39749 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fen1P39749 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fen1P39749 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fen1P39749 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fen1P39749 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fen1P39749 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fen1P39749 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fen1P39749 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fen1P39749 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fen1P39749 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fen1P39749 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fen1P39749 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fen1P39749 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fen1P39749 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fen1P39749 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fen1P39749 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fen1P39749 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Fen1P39749 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fen1P39749 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fen1P39749 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fen1P39749 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fen1P39749 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fen1P39749 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fen1P39749 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fen1P39749 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fen1P39749 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fen1P39749 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fen1P39749 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fen1P39749 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fen1P39749 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fen1P39749 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fen1P39749 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fen1P39749 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Fen1P39749 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fen1P39749 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fen1P39749 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fen1P39749 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fen1P39749 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Fen1P39749 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fen1P39749 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fen1P39749 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fen1P39749 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fen1P39749 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fen1P39749 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fen1P39749 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fen1P39749 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fen1P39749 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fen1P39749 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fen1P39749 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fen1P39749 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fen1P39749 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fen1P39749 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fen1P39749 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Fen1P39749 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Fen1P39749 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fen1P39749 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fen1P39749 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fen1P39749 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fen1P39749 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Fen1P39749 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fen1P39749 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fen1P39749 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fen1P39749 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fen1P39749 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fen1P39749 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fen1P39749 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms