Protein–RNA interactions for Protein: P35601

Rfc1, Replication factor C subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc1P35601 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rfc1P35601 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rfc1P35601 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rfc1P35601 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rfc1P35601 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rfc1P35601 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rfc1P35601 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rfc1P35601 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rfc1P35601 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rfc1P35601 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rfc1P35601 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rfc1P35601 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rfc1P35601 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rfc1P35601 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rfc1P35601 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rfc1P35601 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rfc1P35601 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rfc1P35601 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rfc1P35601 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms