Protein–RNA interactions for Protein: P35460

Ly6f, Lymphocyte antigen 6F, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6fP35460 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ly6fP35460 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ly6fP35460 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ly6fP35460 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ly6fP35460 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ly6fP35460 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ly6fP35460 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ly6fP35460 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ly6fP35460 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ly6fP35460 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ly6fP35460 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ly6fP35460 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ly6fP35460 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ly6fP35460 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ly6fP35460 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ly6fP35460 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ly6fP35460 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ly6fP35460 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ly6fP35460 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ly6fP35460 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ly6fP35460 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ly6fP35460 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ly6fP35460 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ly6fP35460 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ly6fP35460 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ly6fP35460 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ly6fP35460 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ly6fP35460 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ly6fP35460 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ly6fP35460 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ly6fP35460 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ly6fP35460 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ly6fP35460 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ly6fP35460 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ly6fP35460 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ly6fP35460 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ly6fP35460 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ly6fP35460 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ly6fP35460 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ly6fP35460 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ly6fP35460 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ly6fP35460 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ly6fP35460 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ly6fP35460 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ly6fP35460 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ly6fP35460 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ly6fP35460 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ly6fP35460 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ly6fP35460 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ly6fP35460 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ly6fP35460 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ly6fP35460 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ly6fP35460 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ly6fP35460 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ly6fP35460 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ly6fP35460 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ly6fP35460 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ly6fP35460 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ly6fP35460 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ly6fP35460 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ly6fP35460 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ly6fP35460 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ly6fP35460 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ly6fP35460 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ly6fP35460 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ly6fP35460 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ly6fP35460 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ly6fP35460 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ly6fP35460 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ly6fP35460 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ly6fP35460 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ly6fP35460 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ly6fP35460 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ly6fP35460 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ly6fP35460 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ly6fP35460 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ly6fP35460 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ly6fP35460 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ly6fP35460 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ly6fP35460 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ly6fP35460 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ly6fP35460 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ly6fP35460 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ly6fP35460 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ly6fP35460 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ly6fP35460 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ly6fP35460 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ly6fP35460 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ly6fP35460 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ly6fP35460 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ly6fP35460 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ly6fP35460 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ly6fP35460 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ly6fP35460 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ly6fP35460 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ly6fP35460 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ly6fP35460 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ly6fP35460 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ly6fP35460 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ly6fP35460 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms