Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab20P35295 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab20P35295 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab20P35295 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab20P35295 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab20P35295 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab20P35295 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab20P35295 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab20P35295 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab20P35295 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab20P35295 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab20P35295 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab20P35295 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab20P35295 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab20P35295 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab20P35295 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab20P35295 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms