Protein–RNA interactions for Protein: P35288

Rab23, Ras-related protein Rab-23, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab23P35288 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab23P35288 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab23P35288 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab23P35288 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab23P35288 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms