Protein–RNA interactions for Protein: P34152

Ptk2, Focal adhesion kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptk2P34152 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ptk2P34152 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ptk2P34152 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ptk2P34152 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ptk2P34152 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ptk2P34152 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ptk2P34152 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ptk2P34152 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ptk2P34152 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ptk2P34152 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ptk2P34152 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptk2P34152 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptk2P34152 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptk2P34152 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptk2P34152 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms