Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Saa4P31532 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Saa4P31532 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Saa4P31532 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Saa4P31532 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Saa4P31532 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Saa4P31532 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Saa4P31532 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Saa4P31532 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Saa4P31532 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Saa4P31532 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Saa4P31532 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Saa4P31532 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Saa4P31532 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Saa4P31532 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Saa4P31532 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Saa4P31532 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Saa4P31532 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Saa4P31532 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Saa4P31532 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Saa4P31532 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Saa4P31532 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Saa4P31532 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms