Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms