Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Hoxd10P28359 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Hoxd10P28359 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Hoxd10P28359 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
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Hoxd10P28359 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Hoxd10P28359 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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