Protein–RNA interactions for Protein: P28312

Defa5, Alpha-defensin 5, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa5P28312 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa5P28312 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa5P28312 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa5P28312 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa5P28312 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa5P28312 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa5P28312 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa5P28312 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa5P28312 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa5P28312 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa5P28312 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa5P28312 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa5P28312 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa5P28312 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa5P28312 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa5P28312 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa5P28312 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa5P28312 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms