Protein–RNA interactions for Protein: P28309

Defa2, Alpha-defensin 2, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa2P28309 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa2P28309 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa2P28309 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa2P28309 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa2P28309 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa2P28309 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.5 ms