Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms