Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gjc1P28229 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjc1P28229 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjc1P28229 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjc1P28229 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjc1P28229 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjc1P28229 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjc1P28229 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjc1P28229 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjc1P28229 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjc1P28229 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjc1P28229 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjc1P28229 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjc1P28229 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjc1P28229 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjc1P28229 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjc1P28229 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjc1P28229 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjc1P28229 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjc1P28229 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjc1P28229 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjc1P28229 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjc1P28229 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjc1P28229 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjc1P28229 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjc1P28229 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjc1P28229 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjc1P28229 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjc1P28229 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjc1P28229 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjc1P28229 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjc1P28229 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjc1P28229 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjc1P28229 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjc1P28229 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjc1P28229 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjc1P28229 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjc1P28229 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjc1P28229 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjc1P28229 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjc1P28229 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjc1P28229 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjc1P28229 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjc1P28229 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjc1P28229 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjc1P28229 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjc1P28229 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjc1P28229 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjc1P28229 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjc1P28229 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjc1P28229 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjc1P28229 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjc1P28229 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjc1P28229 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjc1P28229 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjc1P28229 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjc1P28229 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjc1P28229 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjc1P28229 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjc1P28229 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjc1P28229 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjc1P28229 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjc1P28229 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjc1P28229 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjc1P28229 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjc1P28229 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjc1P28229 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjc1P28229 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjc1P28229 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjc1P28229 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjc1P28229 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjc1P28229 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjc1P28229 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjc1P28229 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjc1P28229 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjc1P28229 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjc1P28229 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjc1P28229 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjc1P28229 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjc1P28229 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjc1P28229 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjc1P28229 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjc1P28229 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjc1P28229 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjc1P28229 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjc1P28229 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjc1P28229 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjc1P28229 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjc1P28229 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjc1P28229 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjc1P28229 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjc1P28229 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjc1P28229 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjc1P28229 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjc1P28229 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjc1P28229 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjc1P28229 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjc1P28229 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjc1P28229 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjc1P28229 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms