Protein–RNA interactions for Protein: P28028

Braf, Serine/threonine-protein kinase B-raf, mousemouse

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Length 804 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BrafP28028 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
BrafP28028 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
BrafP28028 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
BrafP28028 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
BrafP28028 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
BrafP28028 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
BrafP28028 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
BrafP28028 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
BrafP28028 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
BrafP28028 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
BrafP28028 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
BrafP28028 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
BrafP28028 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
BrafP28028 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
BrafP28028 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
BrafP28028 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
BrafP28028 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
BrafP28028 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
BrafP28028 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
BrafP28028 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
BrafP28028 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
BrafP28028 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
BrafP28028 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BrafP28028 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BrafP28028 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BrafP28028 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BrafP28028 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BrafP28028 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BrafP28028 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
BrafP28028 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BrafP28028 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BrafP28028 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
BrafP28028 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
BrafP28028 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BrafP28028 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
BrafP28028 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BrafP28028 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BrafP28028 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BrafP28028 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BrafP28028 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BrafP28028 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BrafP28028 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
BrafP28028 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
BrafP28028 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BrafP28028 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BrafP28028 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
BrafP28028 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
BrafP28028 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
BrafP28028 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
BrafP28028 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
BrafP28028 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
BrafP28028 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BrafP28028 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BrafP28028 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BrafP28028 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BrafP28028 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BrafP28028 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BrafP28028 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BrafP28028 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BrafP28028 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BrafP28028 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BrafP28028 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BrafP28028 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BrafP28028 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BrafP28028 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BrafP28028 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BrafP28028 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BrafP28028 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BrafP28028 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BrafP28028 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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BrafP28028 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BrafP28028 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BrafP28028 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
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BrafP28028 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BrafP28028 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BrafP28028 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BrafP28028 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BrafP28028 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BrafP28028 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BrafP28028 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BrafP28028 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BrafP28028 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BrafP28028 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
BrafP28028 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BrafP28028 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BrafP28028 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BrafP28028 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BrafP28028 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BrafP28028 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BrafP28028 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BrafP28028 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BrafP28028 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BrafP28028 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BrafP28028 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BrafP28028 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BrafP28028 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BrafP28028 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BrafP28028 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms