Protein–RNA interactions for Protein: P27641

Xrcc5, X-ray repair cross-complementing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 732 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc5P27641 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Xrcc5P27641 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Xrcc5P27641 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Xrcc5P27641 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Xrcc5P27641 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Xrcc5P27641 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Xrcc5P27641 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Xrcc5P27641 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Xrcc5P27641 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Xrcc5P27641 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
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Xrcc5P27641 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Xrcc5P27641 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
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Xrcc5P27641 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Xrcc5P27641 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Xrcc5P27641 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Xrcc5P27641 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Xrcc5P27641 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Xrcc5P27641 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Xrcc5P27641 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Xrcc5P27641 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Xrcc5P27641 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Xrcc5P27641 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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Xrcc5P27641 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Xrcc5P27641 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Xrcc5P27641 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
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Xrcc5P27641 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Xrcc5P27641 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Xrcc5P27641 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Xrcc5P27641 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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Xrcc5P27641 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Xrcc5P27641 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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Xrcc5P27641 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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Xrcc5P27641 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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Xrcc5P27641 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Xrcc5P27641 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Xrcc5P27641 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Xrcc5P27641 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Xrcc5P27641 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Xrcc5P27641 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Xrcc5P27641 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Xrcc5P27641 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Xrcc5P27641 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Xrcc5P27641 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Xrcc5P27641 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Xrcc5P27641 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Xrcc5P27641 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Xrcc5P27641 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Xrcc5P27641 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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Xrcc5P27641 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
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