Protein–RNA interactions for Protein: P26043

Rdx, Radixin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RdxP26043 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RdxP26043 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RdxP26043 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RdxP26043 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RdxP26043 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RdxP26043 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RdxP26043 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RdxP26043 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RdxP26043 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RdxP26043 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RdxP26043 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RdxP26043 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RdxP26043 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RdxP26043 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RdxP26043 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RdxP26043 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RdxP26043 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RdxP26043 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RdxP26043 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RdxP26043 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RdxP26043 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RdxP26043 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RdxP26043 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RdxP26043 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RdxP26043 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RdxP26043 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RdxP26043 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RdxP26043 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RdxP26043 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RdxP26043 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RdxP26043 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RdxP26043 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RdxP26043 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RdxP26043 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RdxP26043 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RdxP26043 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RdxP26043 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RdxP26043 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RdxP26043 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RdxP26043 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RdxP26043 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RdxP26043 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RdxP26043 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RdxP26043 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RdxP26043 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RdxP26043 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RdxP26043 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RdxP26043 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RdxP26043 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RdxP26043 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RdxP26043 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RdxP26043 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RdxP26043 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RdxP26043 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RdxP26043 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RdxP26043 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RdxP26043 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RdxP26043 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RdxP26043 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RdxP26043 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RdxP26043 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RdxP26043 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RdxP26043 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RdxP26043 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RdxP26043 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RdxP26043 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RdxP26043 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RdxP26043 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RdxP26043 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RdxP26043 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RdxP26043 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RdxP26043 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RdxP26043 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RdxP26043 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RdxP26043 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RdxP26043 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RdxP26043 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RdxP26043 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RdxP26043 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RdxP26043 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RdxP26043 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RdxP26043 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RdxP26043 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RdxP26043 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RdxP26043 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RdxP26043 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RdxP26043 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RdxP26043 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RdxP26043 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RdxP26043 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RdxP26043 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RdxP26043 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RdxP26043 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RdxP26043 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RdxP26043 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RdxP26043 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RdxP26043 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RdxP26043 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RdxP26043 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RdxP26043 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms